南方科技大学先进光源科学中心为深圳中能高重复频率自由电子激光装置建设提供科学支撑；该中心基于先进光源在材料科学、生物医药、能源催化、原子分子物理、极紫外光化学、加速器物理与技术、超快激光物理、X射线光学应用、先进科学仪器制造等领域开展世界领先的科学技术研究，致力于建设具有全球影响力的先进光子科学中心；同时，建设相关方向国际一流学科，以支撑南方科技大学建设世界一流研究型大学。